地下ピット埋戻しに伴う底盤穴あけについて

質問します。
機械式駐車場（地下3段程度ＧＬ-3000）解体後地下ピット埋戻しに際、よく底盤に穴をあけますが砂にて埋戻しを行い、アスファルト舗装を行えば入水は少なく
逆にあけることによって地下水が絶えずピット内を行き来するならばあける必要はないように思っているのですが皆様の見解をお願いいたします。