鉄筋継手の高応力繰返し性能照査について

「鉄筋定着・継手指針[2007年版]」3.2.4章（p.37～）について質問があります。
そこには、塑性ヒンジ部の継手の信頼度および等級に応じた照査方法が記載されております。
その中で適用予定の継手が「fjk/γsと0.9fjk/γsの両方で照査」に分類される場合、具体的にどのような方法で設計（照査）すればいいのでしょうか。

現在、ボックスカルバート（道路構造物）の耐震設計をしております。
手法は応答震度法で、部材は非線形（M～φ）の梁モデルとなります。

指針からは、M～φ算定時に継手位置の強度を1.0と0.9とした２ケースの計算を実施する必要があると読み取れますが、
設計段階で継手位置が具体的に決まっていない、または施工対応で継手位置が変わる可能性があることを踏まえると
どのような対応をしておくべきなのでしょうか。

よろしくお願いします。