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◆回答者さんは、なにか思い違いをしている気がしてならないのですが
　「共同溝」と、「電線共同溝」「情報ＢＯＸ」は別物です。

　イメージは下記ページなど参照ください。
　「大宮国道のしごと > 道路の機能向上のために > 共同溝」
　http://www.ktr.mlit.go.jp/oomiya/02sigoto/kinou/kyodo.htm

　今回質問の「覆工板開閉工」は、いわゆる大型の共同溝工に適用されるもので
　「電線共同溝」「情報ＢＯＸ」の場合は、また別の歩掛を使用します。

　共同溝工の場合、都市部の道路の下を広く深く掘ることが多いので、
　最初に覆工をかけたら、掘削や土留支保工、躯体構築、埋戻しといった作業は、基本的に覆工の下で行います。
　日頃の覆工開閉は、路上の交通影響を防ぐため、必要最小限しか行いません。
　（掘削でクラムシェルのバケットを突っ込んだり、資機材を搬入したり、コンクリートポンプの配管を入れたりするような作業のため）
　質問者さんのおっしゃるように、200m2当たり、10～20m2（覆工板３枚～８枚程度）を開閉する程度です。

　電線共同溝や情報ＢＯＸ工で、１工事で200m2もの覆工を行うことは、よほど特殊な場合でなければ、有りえません。

◆本題に戻ると
　覆工板開閉の費用としては、１回・１m2（または１枚）当たりの単価を設定するのが、もっともわかりやすいのですが
　では、１工事当たり何回、何m2分の開閉を見込めばよいのか？と問われると
　設計図や、工程表や、仮設計画を精査しないと決められないので、
　積算の簡略化を図るため、１工事全体での覆工設置面積をパラメータとして設定したものと考えられます。

　別記の回答で私が書きましたように、１日・１回当たりの覆工開閉作業は数十分という短いものですから
　数か月、日々開閉作業を行ったとしても、延べで考えれば 100m2当たり約2.8日（＝22.4時間＝1344分）という積算基準上の見込みは、実勢とそう変わらないものと推察します。
　毎日、覆工全体の半分以上を開閉しなければならない・・・というような特殊な場合なら別ですが。

　質問者様にあっては、１回・m2での集計ではなくて、
　工事全体で、開閉にかかった作業が延べ時間で何分で、人員・機械を何人×何分費やしたのか、集計してみることをおすすめします。
　それを積算基準の歩掛
　「覆工（１工事での全体設置面積）　◆◆◆１００m2当たり◆◆◆」
　　　・世話役　2.8人（＝1344分）
　　　・とび工　5.5人（＝2640分）
　　　・普通作業員　3.3人（＝1584分）
　　　・クレーン　2.6台日（＝1248分）
　と照らし合わせてみて、大きく乖離があるようなら、協議する価値もあるかと思います。
　おそらく、それほど変わらないと思いますよ。